Simulación de la Actividad Eléctrica Cardiaca: Una Implementación Basada en Computación de Altas Prestaciones

J M Alonso, J M Ferrero (Jr.), V Hernández, G Moltó, M Monserrat, and J Saiz. Simulación de la Actividad Eléctrica Cardiaca: Una Implementación Basada en Computación de Altas Prestaciones. In Libro de Actas de las XIV Jornadas de Paralelismo, 15-17 de Septiembre de 2003, Leganés-Madrid, pp. 33–38, 2003.

Download

(unavailable)

Abstract

La simulación de la propagación del potencial de acción en un tejidocardiaco es un proceso con unos elevados tiempos de computación yunos enormes requerimientos de memoria. La creciente necesidad desimular tejidos de mayores dimensiones durante más tiempo, juntocon el uso de modelos celulares realistas, está demandando el usode recursos computacionales a gran escala. Este artículo presentauna implementación paralela sobre un cluster de PCs de la simulaciónde la propagación de la actividad eléctrica en tejidos cardiacos,empleando modelos bidimensionales monodominio. Las técnicas basadasen la Computación de Altas Prestaciones han reducido los tiemposde simulación en un factor muy cercano al número de procesadores,alcanzando una eficiencia de un 94% al usar 32 procesadores. Másaún, la aplicación de métodos estables de integración numérica hapermitido que los tiempos de paso de simulación sean mayores, reduciendoasí el tiempo de simulación global.

BibTeX Entry

@inproceedings{Molto2003sae,
   abstract = {La simulación de la propagación del potencial de acción en un tejido
cardiaco es un proceso con unos elevados tiempos de computación y
unos enormes requerimientos de memoria. La creciente necesidad de
simular tejidos de mayores dimensiones durante más tiempo, junto
con el uso de modelos celulares realistas, está demandando el uso
de recursos computacionales a gran escala. Este artículo presenta
una implementación paralela sobre un cluster de PCs de la simulación
de la propagación de la actividad eléctrica en tejidos cardiacos,
empleando modelos bidimensionales monodominio. Las técnicas basadas
en la Computación de Altas Prestaciones han reducido los tiempos
de simulación en un factor muy cercano al número de procesadores,
alcanzando una eficiencia de un 94% al usar 32 procesadores. Más
aún, la aplicación de métodos estables de integración numérica ha
permitido que los tiempos de paso de simulación sean mayores, reduciendo
así el tiempo de simulación global.},
   author = {J M Alonso and J M Ferrero (Jr.) and V Hernández and G Moltó and M Monserrat and J Saiz},
   booktitle = {Libro de Actas de las XIV Jornadas de Paralelismo, 15-17 de Septiembre de 2003, Leganés-Madrid},
   pages = {33-38},
   title = {Simulación de la Actividad Eléctrica Cardiaca: Una Implementación Basada en Computación de Altas Prestaciones},
   year = {2003}
}